فهرست برندگان جشنواره سن سباستین 2016 به شرح زیر است:

بخش مسابقه اصلی

صدف طلایی: "من مادام بواری نیستم" به کارگردانی فنگ شیائوگانگ (چین)

جایزه ویژه هیئت داوران: "زمستان" به کارگردانی امیلیانو تورس (آرژانتین و فرانسه) و "غول" به کارگردانی یوهانس نیهولم (سوئد و دانمارک)

صدف نقره‌ای بهترین کارگردان: هونگ سانگ-سو برای "خودت و مال خودت" (کره جنوبی)

صدف نقره‌ای بهترین بازیگر زن: فان بینگ‌بینگ برای "من مادام بواری نیستم" به کارگردانی فنگ شیائوگانگ (چین)

صدف نقره‌ای بهترین بازیگر مرد: ادوارد فرناندس برای "دود و آینه‌ها" به کارگردانی آلبرتو رودریگس (اسپانیا)

بهترین فیلمبرداری: رامیرو سیویتا برای "زمستان" به کارگردانی امیلیانو تورس (آرژانتین و فرانسه)

بهترین فیلمنامه: ایزابل پنیا و ریکاردو سوروگوین برای "خدا ما را حفظ کند" (May God Save Us) (اسپانیا) به کارگردانی رودیگو سوروگوین

دیگر جوایز اصلی

جایزه کارگردانان جدید Kutxa: "پارک" به کارگردانی سوفیا اکسارکو (یونان و لهستان)

تقدیر: "طعم جوهر" (A Taste of Ink) به کارگردانی مورگان سیمون (فرانسه)

جایزه افق‌های لاتین: "رارا" به کارگردانی پپا سان مارتین (آرژانتین و شیلی)

تقدیر: "آلبا" به کارگردانی آنا کریستینا باراگان (اکوادور، مکزیک و یونان)

جایزه زابالتگی-تاباکالرا: "آن پرسش را بخور: فرانک زاپا به روایت خودش" (Eat That Question: Frank Zappa In His Own Words) به کارگردانی تورستن شوته (فرانسه و آلمان)

تقدیر: " The Disco Shines" به کارگردانی چما گارسیا ایبارا (ترکیه)

جایزه تماشاگران: "من، دانیل بلیک" (I, Daniel Blake) به کارگردانی کن لوچ (بریتانیا، فرانسه و بلژیک)

جایزه تماشاگران، فیلم اروپایی: "زندگی من به عنوان یک کدوسبز" (My Life as a Courgette) به کارگردانی کلود باراس (فرانسه و سوئیس)

جایزه جوان: "واسطه" (In Between) به کارگردانی میسلون حمود (اسرائیل و فرانسه)